Tese de Doutorado #306: Patrícia Sales

Efeitos da elasticidade e blindagem eletrostática nas interações DNA-ligantes estudados via a técnica de pinçamento óptico

Autor: Patrícia Santos Alves Sales

Banca Avaliadora

Oscar Nassif de Mesquita (orientador)

Física - UFMG

Márcio Santos Rocha (coorientador)

DF/UFV

Gerald Weber

Física - UFMG

José Marcos de Andrade Figueiredo

Física - UFMG

Aline Duarte Lúcio

DF/UFLA

Márcia Cristina Bernardes Barbosa

IF/UFRGS

Orientadores

Oscar Nassif de Mesquita (orientador)

Departamento de Física - UFMG

Márcio Santos Rocha (coorientador)

Departamento de Física - UFV

Resumo do Trabalho

Realizamos medidas da elasticidade entrópica de complexos DNA-ligantes. Foram feitas medidas de estiramentos de moléculas únicas usando a técnica de pinçamento óptico, no qual o comprimento de contorno e o comprimento de persistência do complexo podem ser medidos. Usamos a b-ciclodextrina neutra, em concentrações da ordem de milimolar, e pelos dados do comprimento de persistência em função da concentração deste fármaco observamos um processo cooperativo na interação DNA-b-ciclodextrina. Os resultados indicam que o balanço de forças atrativas e repulsivas é um mediador da cooperatividade na interação deste complexo. Caracterizamos também a interação entre a lisozima e a molécula de DNA realizando estiramentos de moléculas únicas em diferentes concentrações de sódio. Os resultados sugerem que o comportamento não monotônico do comprimento de persistência do complexo lisozima-DNA em função da concentração desta proteína se deve a competição entre dois fatores: o aumento do raio do complexo que aumenta a rigidez do mesmo e a diminuição da densidade de carga que diminui o comprimento de persistência do complexo lisozima-DNA. Além disso, os resultados experimentais indicam uma mudança na conformação da lisozima ao alteramos a blindagem desta proteína, ao mudar a concentração de sódio na amostra.