Com base nos resultados obtidos nos primeiros anos de estudo da ictiofauna da bacia, o subprojeto S.O.S. Rio das Velhas está realizando neste ano (2001), com financiamento da ``Fundação O Boticário de Proteção à Natureza'', o levantamento da fauna dos principais tributários do médio e baixo rio das Velhas e da lagoa central do município de Lagoa Santa. O levantamento dos afluentes se baseia no fato do rio Cipó ter apresentado elevados índices de riqueza e diversidade de espécies. É possível que esses outros também possuam comunidades de peixes mais preservadas, possibilitando a determinação de áreas prioritárias para conservação e indicação de novas unidades de conservação, baseada, pioneiramente, em sua fauna aquática. A pesquisa em Lagoa Santa, local intensamente estudado por Reinhardt há mais de 150 anos, possibilitará diagnosticar os efeitos da urbanização sobre a ictiofauna.
É importante ressaltar que são necessários estudos de inventário de grande parte dos rios da bacia do São Francisco em Minas Gerais, para se conhecer sua composição em espécies. Comparando-se a situação do passado com a atual, será possível quantificar a extensão dos danos causados nesses cursos. Tais estudos vão desde a taxonomia (descrição e identificação das espécies), biologia básica (reprodução, hábito reprodutivo, tipo de desova, alimentação, crescimento), pesca, relações ecológicas entre as espécies (competição, predação), estrutura de comunidades e populações, interações entre as espécies e os ambientes (locais de desova, de alimentação, de proteção e refúgio), até estudos mais complexos como marcação e recaptura, biotelemetria, genética, entre outros. Só de posse destes dados será possível a implantação de programas efetivos para a conservação da ictiofauna e dos recursos pesqueiros.